开除决定由 事业单位或者事业单位主管部门决定，对于被开除处分的是需要报同级事业单位人事综合管理部门进行备案的。如果是公务员，则是由任免机关或者行政监察机关决定，并且需要报上级机关备案。

具体来说，开除决定根据不同的对象和情境，由不同的部门作出：

事业单位及其主管部门

事业单位有权决定开除其员工，但需报主管部门备案。

公务员及行政监察机关

对公务员的开除处分由任免机关或行政监察机关决定，且需报上级机关备案。

企业单位

企业单位在解除劳动合同时，通常由人事处或人力资源部开具开除通知书，涉及普通员工或一般干部由人事部发，高级管理或中层以上干部由公司董事会下发通知。

建议在具体实施开除决定时，相关部门应严格按照法律法规和内部规章制度执行，确保决定的合法性和公正性。