小产权房是指没有取得国有土地使用权证的房屋，其产权不受法律保护，因此一般不能进行公证。然而，如果确实需要进行公证，可以参考以下步骤和注意事项：
准备材料
当事人需要准备身份证明，如身份证、户口簿等。
提供与约定内容有关的财产所有权证明，如房产证、购房合同和付款发票等（如果有的话）。
双方草拟好的协议书。
填写申请表格
双方亲自到公证处填写有关表格，如《房屋产权公证申请表》。
提供证明材料
提交上述准备好的材料，并如实说明申请公证的事项。
公证员审核
公证员会核对相关信息，审查财产的权利证明文件，查问当事人签订协议是否受到欺诈或胁迫。
当事人需要配合公证员做完公证谈话笔录，并在笔录上签字确认。
签名和手印
在公证员核对完信息之后，双方当事人当着公证员的面在协议书上签名并按手印。
出具公证书
公证机构在审查认为申请提供的证明材料真实、合法、充分，申请公证的事项真实、合法的情况下，应当自受理公证申请之日起十五个工作日内向当事人出具公证书。
需要注意的是，小产权房由于产权不明确，存在法律风险，因此在进行公证时要特别谨慎。此外，根据相关法律规定，小产权房无法进行正式的产权登记和过户，这可能会影响公证的效力和认可度。
建议在办理小产权房公证前，咨询当地公证机构或专业律师，了解具体的法律风险和可能存在的问题。
