建设工程审计的目的是多方面的，主要包括以下几点：
监督财政、财务收支的合法性，项目信息的真实性：
审计可以判断建设项目的建设成本是否真实、可靠，是否存在随意扩大建设规模、挪用、挤占建设资金、盲目采购造成浪费的情况等。
审计建设项目实施过程的合法性：
主要审核工程项目在实施期间是否严格遵守《建筑法》、《招标投标法》等有关规定，项目法人的设立是否符合要求，项目手续是否健全完备，项目立项、实施程序是否合规、合法等。
监督建设单位内控制度的建立：
审计建设单位内控制度是否健全、有无缺少关键业务和管理流程，是否有明确的控制点的职责分工、监督评价、绩效考核等。
预警作用：
工程审计是事前、事中、事后审计相结合的全过程跟踪审计，通过审计，及时发现工程项目管理过程中存在的漏洞以及苗头性、倾向性的违纪违规问题，及时预警并有针对性地提出建议，促进被审计单位及时采取有效措施。
审计工程项目的绩效状况：
绩效审计是审计的重要工作，包括效率审计和效益审计，旨在评估工程项目的经济效益和社会效益。
加强政府的政策监督能力和质量管理能力：
审计机构可以对审计单位的管理机制、实施管理政策的情况以及实施技术措施的情况进行客观、及时的分析，从而为政府提供及时改进政策的可行性建议。
保证工程建设质量：
审计机构会根据国家技术标准对工程建设过程中的材料、施工技术和工程质量进行检测，从而保证工程质量。同时，审计机构还可以对劳务费、款项以及收入支出等情况进行检查，以确保不存在资金挥霍、收费漏洞等情况。
保证公众对建设工程的合法权益：
建设工程审计可以帮助各方共同确定建设工程的执行情况，从而消除纠纷，维护公众的权益。
促进有效控制工程造价和有效改善建设工程管理：
通过审计，可以发现并纠正工程中的问题，防止舞弊行为，改善管理，确保工程目标的顺利实现。
规范项目管理：
工程结算审计是工程造价控制的最后一关，审计质量的好坏直接影响到政府固定资产投资数额的大小，有助于政府完善固定资产台账，从根本上杜绝国有资金流失。
综上所述，建设工程审计对于确保工程项目的合法性、真实性、效益性，加强政府监管能力，保证工程质量，维护公众权益，以及规范项目管理等方面都具有重要意义。
