生产豆芽需要办理的证件主要包括以下几项：

营业执照：

无论是小作坊还是有限公司，都需要办理营业执照。具体办理流程和要求可能因地区而异，建议到当地工商部门咨询。

生产许可证：

豆芽作为食品，其生产需要获得生产许可证。该证件由当地食药监局（或市场监管局）负责办理，具体申请流程需咨询当地食药监局。

食品卫生证：

虽然有些资料中提到生产豆芽只需办理生产许可证和食品卫生证，但为了确保合规经营，建议同时办理食品卫生证。

QS认证：

QS认证（Quality Safety）是食品生产领域的强制性认证，虽然有些资料中提到QS认证费用不高，几千元即可办理，但并非所有豆芽生产企业都需要此认证。如果希望做大做强，建议办理QS认证，以提升企业形象和市场竞争力。

食品流通许可证：

如果豆芽需要在市场上销售，特别是批发或零售，还需要办理食品流通许可证。

健康证：

食品工厂的员工，根据岗位情况，有些需要取得健康证，以确保食品安全。

综上所述，生产豆芽需要办理的主要证件包括营业执照、生产许可证、食品卫生证（如果需要）、QS认证（如果希望做大做强）以及食品流通许可证（如果需要在市场上销售）。建议提前了解当地的具体要求和流程，以确保顺利办理所有必要的证件。