超载查处通常归公安机关交通管理部门负责。根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条的规定，货运机动车超过核定载质量的，由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除，并处以罚款。此外，交通运输部门或公路管理机构也对超限运输行为进行管理。