免抵退企业需要注意以下几点：
期限问题
逾期申报出口货物或逾期收齐出口货物均要按照规定视同内销补缴税款。
企业办理出口退免税认定的期限须在自理报关注册登记证书核发日期的30天内到主管退税部门办理，否则将按照逾期办理税务登记处罚。
新办生产企业前12个月不办理退税的问题
新办的生产企业前12个月不办理退税，但前12个月出口货物所负担的进项税额，有内销则可以抵顶销项税额，无内销也可以继续结转到期末留抵中。前12个月出口货物负担的煤油抵顶完的进项税额，会从13个月开始陆续退付给企业。
变更出口退免税账号等认定事项
须在规定的期限内进行变更出口退免税账号，填写《出口退免税认定表》、《变更出口退税账号证明》、企业法人代表身份证复印件一份（必须要有法人代表签名）、开户许可证等银行证明的资料，分别到主管退税部门进行变更登记。
延期报关单问题
必须在到期申报前到主管退税部门延期，且延期报关单只有如下几种原因才可以办理。
虚拟报关单的程序问题
由于企业退税率调整、录错报关单有关内容和超期补税需要调整数据等主客观原因，企业取用“虚拟报关单”进行调整申报的数量日渐增加。为规范“虚拟报关单”申报操作，避免虚拟出错和便于管理监督，企业可以随时到主管退税部门拷贝有关文件。
委托加工环节的处理
自营出口的生产企业，如果发生部分生产工序自己完成不了，需要委外加工才能完成的时候，账务上应按规定做处理。注意三点：第一，签订加工合同；第二，账务上设置“委托加工物资”反映发出、收回的情况，而不能直接在制造费用中的“加工费”反映；第三，必须向对方取得加工费发票。
分类管理等级
A、B、C、D类的区别，以及如何才能由分类管理等级C转为B，具体规定详见相关文件。
FOB、CFR、CIF的区别
简单地说分别是指：装运港船上交货、成本加运费、成本加保险费加运费。在现行的退免税制度中按照离岸价价格计算退税。因此如果企业遇到报关单上显示CIF价的，须换算成FOB价格申报免抵退。
单证备案和备案清单的问题
企业出口货物后，自备如下四种单证资料：1.购销合同；2.出口装箱单；3.司机纸（陆路运输）或运输单（海运、航运）；4.运输单。企业自行备案如上单证（可选择装订一起或分开存放）后可以。
退税申报期及收汇相关规定
生产企业符合留抵退税政策的，须先做出口免抵退税申报，再申请留抵退税。如果当月没有符合条件的出口免抵退申报数据，需要先做出口退税零申报，才能申请留抵退税。没有申请留抵退税业务的生产企业，不需要进行出口退税零申报。
申报中的工作
企业应在货物报关出口之日次月起至次年4月30日前的各增值税纳税申报期内收齐有关凭证。
登录出口退税申报系统，制作申报数据包并上传，自检疑点一定要改。
收汇问题
纳税人申报退（免）税的出口货物，应当在出口退（免）税申报期（次年4月份申报期内）截止之日前收汇。未在规定期限内收汇，但符合《视同收汇原因及举证材料清单》所列原因的，纳税人留存《出口货物收汇情况表》及举证材料，即可视同收汇；纳税人确实无法收汇且不符合视同收汇规定的出口货物，适用增值税免税政策。税务机关发现纳税人申报退（免）税的出口货物收汇材料为虚假或者冒用的，应当按照《中华人民共和国税收征收管理法》有关规定进行处理，相应的出口货物适用增值税征税政策。
备案单证问题
对于已申报出口退（免）税的出口货物，是否已完成收汇和备案单证是否做好，有明确的规定和要求。
